蛋白组学数据处理系列讲座 | R语言DEP2包

日期:2024/11/13

来源:深圳医学科学院

蛋白组学数据处理系列讲座

R语言DEP2包

时间:2024年11月13日(周三)14:00-15:00

地点:卫光生命科学城4层401-E会议室

主讲人:赵宇曦

主持人:殷海娣 多组学检测分析平台主管

腾讯会议:501 925 812

主讲人

赵宇曦 Yuxi Zhao

广州真诺生物科技有限公司

生信总监


本科毕业于华南农业大学生物科学专业,硕士毕业于深圳大学生物科学专业,师从沈立明教授,前深圳市微纳菲生物技术有限公司生信主管,擅长蛋白质组学实验设计及生物信息学分析,主导处理300+个性化生信项目,在细菌耐药、疾病标志物、药物靶点、多组学机理探索、翻译后修饰、PROTAC及化学蛋白组领域有丰富的生信分析经验。

报告摘要

讲座主要围绕蛋白组学展开,介绍了其研究意义、内容、流程,并以 DEP2包为例阐述了数据处理过程,还涉及蛋白质结构分析、化学蛋白组学以及多组学相关内容,具体如下:

1、以 DEP2 包为例的数据处理流程:包括数据读取与预处理;缺失值处理;差异分析与可视化(差异分析,火山图绘制,聚类分析);富集分析;

2、真实案例分享:包括非模式物种,翻译后修饰,外泌体,PROTAC,新发蛋白抗原肽,热稳定蛋白组( TPP/CETSA,PISA)和限制性酶解质谱分析技术(Lip-MS)的简要介绍和生信分析展示。



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