蛋白组学数据处理系列讲座
R语言DEP2包
时间:2024年11月13日(周三)14:00-15:00
地点:卫光生命科学城4层401-E会议室
主讲人:赵宇曦
主持人:殷海娣 多组学检测分析平台主管
腾讯会议:501 925 812
主讲人
赵宇曦 Yuxi Zhao
广州真诺生物科技有限公司
生信总监
本科毕业于华南农业大学生物科学专业,硕士毕业于深圳大学生物科学专业,师从沈立明教授,前深圳市微纳菲生物技术有限公司生信主管,擅长蛋白质组学实验设计及生物信息学分析,主导处理300+个性化生信项目,在细菌耐药、疾病标志物、药物靶点、多组学机理探索、翻译后修饰、PROTAC及化学蛋白组领域有丰富的生信分析经验。
报告摘要
讲座主要围绕蛋白组学展开,介绍了其研究意义、内容、流程,并以 DEP2包为例阐述了数据处理过程,还涉及蛋白质结构分析、化学蛋白组学以及多组学相关内容,具体如下:
1、以 DEP2 包为例的数据处理流程:包括数据读取与预处理;缺失值处理;差异分析与可视化(差异分析,火山图绘制,聚类分析);富集分析;
2、真实案例分享:包括非模式物种,翻译后修饰,外泌体,PROTAC,新发蛋白抗原肽,热稳定蛋白组( TPP/CETSA,PISA)和限制性酶解质谱分析技术(Lip-MS)的简要介绍和生信分析展示。