生物医学影像平台围绕对于成像空间分辨率、时间分辨率和深度的科研应用需求进行仪器设备建设,辅以图像处理工作站进行多维分析,揭示从分子、细胞组织到活体小动物等多维度生物体的结构与功能。
生物医学影像平台现有配置大型仪器设备19台套,专业图像分析软件3台套。主要设备包括超高分辨显微镜系统(含STED-Facility Line、Multi-SIM、AXR-NSPARC、LSM990等6台套)、激光共聚焦荧光显微镜系统(STELLARIS 8-FLIM、Evident Spin SR、FV4000 共3台套)、光片显微成像系统(LS18)、宽场扫描成像系统(玻片扫描仪VS200、线扫描拉曼显微镜ECLIPSE Ti2-E、多模态成像仪ECLIPSE Ji共3台套)、小动物活体成像系统(含FV4000MPE、Insight-RSPAM3等4台套)、生物成像样本制备系统(TCS-23)以及空间分子成像系统(CosMx Space Molecular Imager)等光学系统设备,空间分辨率上,引入超高分辨共聚焦显微镜(STED-Facility Line),XY分辨率可达30nm,确保清晰捕捉生物体内细微结构;时间分辨率上,全幅帧频最快可达到89.1fps(Evident Spin SR),并搭载活细胞工作站,既可实时追踪生物过程的动态变化,又可进行连续、长时程的拍摄;深度探测上,搭载光片显微镜(LS18)、双光子显微镜(FV4000MPE)以及激光扫描光声显微镜(Insight-RSPAM3),可实现对深层组织(最大探测深度达10mm)的精准成像;结合专业图像分析软件,全面揭示从分子、细胞、组织到活体小动物等多维度生物体的复杂结构与功能;此外,配备全流程病理切片制备系统,为生物成像样本制备提供关键技术支撑。本平台配置的专业图像分析软件包括2台套多维图像分析软件Imaris和1台套多维图像分析软件Amira 3D for Cell Biology。已建成全流程技术能力15项,列表如下(表3.1)。
表3.1 生物医学影像平台全流程服务项目列表
编号 | 服务项目名称 | 涉及大型设备名称 | 归属平台 |
1 | 组织透明化、三维成像和数据分析服务 | 1.组织透明化设备Tissue Clearing Devices 2.光片显微镜Light sheet Microscope 3.多维图像分析软件 3D/4D Image Analysis Software | 生物医学影像平台 |
2 | 石蜡组织脱水包埋服务 | / | 生物医学影像平台 |
3 | 石蜡切片服务 | / | 生物医学影像平台 |
4 | HE染色服务 | / | 生物医学影像平台 |
5 | AB-PAS染色服务 | / | 生物医学影像平台 |
6 | Masson染色服务 | / | 生物医学影像平台 |
7 | 免疫组化切片单标双色染色服务 | / | 生物医学影像平台 |
8 | 常规病理组织脱水包埋切片HE染色全流程服务 | / | 生物医学影像平台 |
9 | 活细胞无标记成像 | 活细胞无标记超分辨共聚焦显微镜AXR-NSPARC/MH-SpotyView | 生物医学影像平台 |
10 | 激光共聚焦成像 | 正置激光扫描共聚焦显微镜AXR-NSPARC | 生物医学影像平台 |
11 | 超分辨成像 | 多模态超分辨活细胞显微镜Multi-SIM | 生物医学影像平台 |
12 | 组织透明化制样 | 组织透明化设备Tissue Clearing Devices | 生物医学影像平台 |
13 | 光片成像 | 光片显微镜Light sheet Microscope | 生物医学影像平台 |
14 | 激光共聚焦成像 | 超高分辨率激光扫描共聚焦显微镜AXR-NSPARC;激光扫描共聚焦显微镜FV4000;快速高分辨共聚焦显微镜STELLARIS 8-FLIM | 生物医学影像平台 |
15 | 超高分辨共聚焦显微镜 STED成像 | 超高分辨共聚焦显微镜STED-Facility Line | 生物医学影像平台 |
本平台自建成以来服务院内及院外用户共计60个课题组,牵头签署对外服务协议6份,开展来自多家高校、医院以及生物医药公司的对外服务。
本平台近期重点开发:1)建立完善的组织透明化技术,全流程闭环解决方案将组织透明化、光片三维成像和图像分析处理整合,通过标准化流程显著提升结果可重复性;2)优化多色荧光成像采集流程,解决光谱重叠导致的串扰和荧光信号的快速漂白等难点问题;3)活细胞无标记成像技术,克服传统超分辨成像技术与活细胞长时程、高保真成像需求之间的矛盾,为活态样本提供无干扰的高分辨率动态观测能力;4)探索空间分子成像技术,实现亚细胞分辨率下超高超多靶标检测,精确解析细胞边界并获取高质量分子信息。
博士毕业于北京大学,主任技师、副教授,主要从事生物医学影像技术的研究并为科研提供技术支持。主编《激光扫描共聚焦显微镜技术教程》,获国家发明专利3项;主持2项、参与多项国自然科学基金项目,发表论文数十篇。
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yuanlan@smart.org.cn
深圳市光明区卫光生命科学园1A栋二层
博士毕业于中山大学,主要负责生物医学影像平台的自动组织脱水机、石蜡包埋机、全自动半薄轮转式切片机、全自动冷冻切片机、全自动染封一体机等相关设备,参与过多项国自然科学基金项目,在Oncogene, Journal of Cellular and Molecular Medicine, Translation Oncology等发表多篇文章。
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liuxueqi@smart.org.cn
深圳市光明区卫光生命科学园1A栋二层
硕士毕业于广州医科大学-中国科学院广州生物医药与健康研究院联合生命科学学院,主要负责超高分辨率激光扫描共聚焦显微镜、多模态超分辨活细胞显微镜和多维图像分析软件等相关设备,致力于通过专业的技术支持,为科研工作和临床研究提供强有力的技术保障。
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huangyi@smart.org.cn
深圳市光明区卫光生命科学园1A栋二层