建立了全方位的重组蛋白表达和制备体系,提供丰富的理化和相互作用分析服务,为生物分子和药物分子的结构功能研究提供坚实的技术支撑,解码生命奥秘,加速药物开发和产业转化。
样品制备与分析平台现有配置大型仪器设备26台套,专业软件20台套。
1)标准化的生物样品分离制备的大型设备
蛋白纯化仪7台,包含AKTA GO,AKTA PURE,AKTA PURE Micro等各类型号及各类纯化柱,可以满足不同需求的蛋白纯化。自动外泌体纯化仪EXODUS H600,用于外泌体的非标记自动化高效纯化。2台超速离心机 Optima XE-100,配置了十多个转子,可满足多种离心分离需求。
2)多维度的生物样品理化表征的大型设备
本平台准确测量生物样品分子量的设备有3类,均可无需标记对样品均一性、聚集状态、复合体组装等表征。其中动静态光散射仪DAWN+OPTILAB+DynaPro NanoStar II,可与SEC等联机使用,测定分子量,流体力学半径等;质量光度计Two MP,在单粒子水平上快速测定分子量;分析型超速离心机Optima AUC,测定沉降系数、流体力学半径、分子量等,样品可回收。
本平台测量生物样品热稳定性的设备有2类,可准确测量无标记的样品的热变性温度(Tm)。主要用于蛋白质的稳定性研究,生物制药开发等。其中热差示扫描量热仪MicroCal PEAQ-DSC Automated,还能获得T1/2(半峰宽)、△H(焓变)、△Hv、△Cp等热稳定性参数,具有自动化、缓冲液兼容性极佳等优点;圆二色光谱仪Chirascan V100 ,具有样品使用量少和实时监测二级结构状态的优点,还广泛应用于各类手性化合物、蛋白质二级结构分析等,配置了停留装置监测毫秒级的结合及反应的动力学变化等。
本平台还配备了测量生物样品其他理化性质的设备。其中多功能微孔板检测仪Spark,配置了光吸收、荧光强度、时间分辨荧光、化学发光、Alpha、荧光偏振等检测模块,应用于样品定量定性分析、分子结合研究等;多路复用免疫测定仪Bio-Plex 200,利用微球/磁珠双荧光标记和流式检测技术,自动实现生物分子的多通道、高通量、高灵敏度定量分析。
3)丰富的生物样品互作表征的大型设备
本平台配备了8类基于不同原理测量生物样品间相互作用的设备,可应用于药物靶点验证、先导化合物筛选、抗体表征与表位分析等领域(详见表1.1)。其中微量热泳动仪Monolith,通过检测荧光分子的热泳动效应主要获得平衡解离常数(KD),而等温滴定量热仪Microcal PEAQ-ITC,无需标记和固定,利用检测结合吸放热变化,还能获得化学计量比(n),熵变(ΔS)和焓变(ΔH);高通量分子相互作用仪Biacore 8K+和生物分子相互作用仪Biacore 1K+利用SPR原理、生物膜干涉仪Octet R8利用生物膜干涉原理、桌面式荧光相关光谱单分子分析仪SX300利用荧光相关光谱(FCS)等技术、多模态分子互作分析仪heliX+基于switchSENSE技术用于同时解析二元与三元复合物形成、原生分子细胞互作分析仪Helix cyto 依托scIC技术用于活细胞水平原生互作精准检测,均能获得KD,动力学参数(Kon、Koff)等; 此外细胞相互作用分析仪z-Movi,基于超声共振技术,实现细胞与细胞、细胞与生物大分子之间整体亲合力(avidity/pN)的定量表征。
表1.1 样品制备与分析平台基于不同原理测量生物样品间相互作用的设备
设备名称/型号 | 设备原理 | 直接获得的 核心参数 | 推荐使用 场景 | 配体 | 分析物 |
微量热泳动仪/Monolith | 微量热泳动技术 | KD | 极速亲和力验证 | 荧光标记、可无需纯化 | 纯化样品 |
桌面式荧光相关光谱单分子分析仪/SX300 | 荧光相关光谱等技术 | KD, Kon, Koff | 细胞裂解液中检测 | 荧光标记、可无需纯化 | 纯化样品,或荧光标记的非纯化样品 |
等温滴定量热仪/Microcal PEAQ-ITC | 直接测量结合中的热量变化 | KD,n,ΔH | 样品无需标记或固定 | 纯化样品 | 纯化样品 |
高通量分子相互作用仪/Biacore 8K+ | 表面等离子共振原理 | KD, Kon, Koff | 高通量动力学筛选 | 固定到芯片 | 纯化样品 |
生物分子相互作用仪/Biacore 1K+ | 深入动力学表征 | ||||
生物膜干涉仪/Octet R8 | 生物膜干涉原理 | KD, Kon, Koff | 高通量动力学筛选 | 固定到传感器 | 纯化样品 |
多模态分子互作分析仪/HeliX+ | switchSENSE技术 | KD, Kon, Koff | 研究二元与三元复合物形成 | 固定到传感器 | 纯化样品 |
原生分子细胞互作分析仪/Helix cyto | scIC 技术 | KD, Kon, Koff | 生物膜上原位结合 | 细胞固定到芯片 | 荧光标记样品 |
细胞相互作用分析仪/z-Movi | 超声共振技术 | 亲合力(单位pN) | 细胞-细胞互作,细胞-基质互作 | 细胞固定到芯片 | 荧光标记细胞 |
说明:平衡解离常数(KD);化学计量比(n);结合速率常数(Kon);解离速率常数(Koff);焓变(ΔH) | |||||
样品制备与分析平台已建成技术能力17项,列表如下(表1.1),包括蛋白质纯化、蛋白质表达(原核体系)、蛋白质表达(293F体系)、质粒构建、圆二色光谱表征、快速反应动力学检测、分析型超速离心检测、热稳定性的检测、毛细管电泳检测、SPR互作检测、BLI互作检测、微量热泳动MST互作检测、动物生化指标检测、动物血常规检测、蛋白分子量分布测定、等温滴定量热法测定生物分子互作、SEC-Mals蛋白样品分子量检测、样品粒径分布分析、蛋白-蛋白相互作用分析、蛋白-核酸相互作用分析、蛋白-小分子相互作用分析、蛋白质聚集分析等。
表1.1 样品制备与分析平台全流程服务项目列表
编号 | 服务项目名称 | 涉及设备名称 | 归属平台 |
1 | 蛋白质纯化 | 蛋白纯化仪AKTA PURE | 样品制备与分析平台 |
2 | 蛋白质表达(原核体系) | / | 样品制备与分析平台 |
3 | 蛋白质表达(293F体系) | / | 样品制备与分析平台 |
4 | 质粒构建 | / | 样品制备与分析平台 |
5 | 圆二色光谱表征 | 圆二色光谱仪 Chirascan V100 | 样品制备与分析平台 |
6 | 快速反应动力学检测 | 圆二色光谱仪Chirascan V100 | 样品制备与分析平台 |
7 | 分析型超速离心检测 | 分析型超速离心机Optima AUC | 样品制备与分析平台 |
8 | 热稳定性的检测 | 热差示扫描量热仪MicroCal PEAQ-DSC Automated | 样品制备与分析平台 |
9 | 毛细管电泳检测 | 毛细管电泳仪 CESI 8000 PLUS | 样品制备与分析平台 |
10 | SPR互作检测 | 高通量分子相互作用仪Biacore 8K+;生物分子相互作用仪Biacore 1K+ | 样品制备与分析平台 |
11 | BLI互作检测 | 生物膜干涉仪Octet R8 | 样品制备与分析平台 |
12 | 微量热泳动MST互作检测 | 微量热泳动仪Monolith | 样品制备与分析平台 |
13 | 动物生化指标检测 | 动物专用全自动生化分析仪迈瑞-BS-240 Vet | 样品制备与分析平台 |
14 | 动物血常规检测 | 动物专用全自动血液分析仪迈瑞-BC-65RVet | 样品制备与分析平台 |
15 | 蛋白分子量与分布测定 | 动静态光散射仪DAWN+OPTILAB+DynaPro NanoStar II | 样品制备与分析平台 |
16 | 等温滴定量热法测定生物分子互作 | 等温滴定量热仪Microcal PEAQ-ITC | 样品制备与分析平台 |
17 | 蛋白质聚集分析 | 质量光度计TwoMP | 样品制备与分析平台 |
自建成以后,已服务课题组超80个,与外院超20课题组签订服务协议,完成全流程技术服务超35次,发送实验结果报告8份。被致谢论文3篇,其中Li Y et al. Mechanism of D-type cyclin recognition by the AMBRA1 E3 ligase receptor. Sci Adv. 2025应用ITC技术,实现T286位点磷酸化的cyclin D1的 C末端与DDB1-AMBRA1WD40复合物的亲和力大小测定;Su M et al. Architecture of the human KICSTOR and GATOR1–KICSTOR complexes. Cell Res. 2025文章应用MST技术,实现野生型/突变型SZT2、 KPTN 、ITFG2及His–C12orf66(kicstor)与NPRL3、DEPDC5和NPRL2(GATOR1)亲和力大小的测定;Zhou H et al. A paracrine-to-autocrine shunt of GREM1 fuels colorectal cancer metastasis via ACVR1C. Mol. Cancer 2026文章应用MST技术,实现ACVR1C- ECD -Fc与GREM1-his或激活素B-his结合情况的分析。
本平台近期重点开发1)双泵法制备密度梯度液技术,用于解决制备不同密度梯度液程序不一致的痛点问题;2)纳米抗体筛选服务技术,更高效地发现针对“困难”靶点或特殊表位的纳米抗体,用于前沿药物开发、结构生物学稳定构象、超高灵敏度诊断等。
博士毕业于清华大学,主要运用电镜以及生理学方法研究与重大疾病相关的膜蛋白,解构其功能和作用机制。同时还是深圳医学科学院特聘研究员,获国家自然科学基金优秀青年基金、青年基金和面上项目等,在国际顶级学术期刊Science上以第一作者(含共一)发表文章5篇,以共通讯作者在PNAS、Nature Communications等杂志发表文章8篇。
13501194765
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博士毕业于南开大学,主要负责蛋白纯化仪、等温滴定微量热仪、微量热泳动仪、高通量分子相互作用仪、自动外泌体纯化仪、圆二色光谱仪、分析型超速离心机、多路复用免疫测定仪、动静态光散射仪等相关设备。获国家自然科学基金面上项目、深圳市科创委自由探索项目、博士后科学基金项目等。深圳市高层次专业人才,在Nature Communications、Cell Reports等高水平杂志上以第一作者(含共一)发表文章7篇。
13671959351
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深圳市光明区卫光生命科学园1A栋三层
博士毕业于中山大学,主要负责高通量分子相互作用仪Biacore 8K+、生物膜干涉仪Octet R8以及原核和酵母表达系统等相关设备。参与过国自然科学基金项目、深圳市基础研究专项(自然科学基金)重点项目和面上项目;研究成果以共同第一作者参与发表在Nature Communications和Biosensor & Bioelectronics刊物。
15625063726
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硕士毕业于南方科技大学,主要负责超速离心机、AKTA蛋白纯化仪、酶标仪、动静态光散射仪等相关设备,擅长蛋白质的表达纯化与理化性质检测和相互作用分析,曾参与过国自然科学基金项目,并以共一作者身份在Cell Reports上发表研究性论文,拥有3篇专利。
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zhangjing@smart.org.cn
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硕士毕业于汕头大学,主要负责荧光定量PCR仪、密度梯度制备与分离系统、自动外泌体纯化仪、多功能微孔板检测仪、蛋白纯化仪等相关设备,掌握minigene技术、RNA immunoprecipitation(RIP)、RNA pull down、Transwell 、MTS等实验方法,参与过多项国自然科学基金项目。
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zhouyingxin@smart.org.cn
深圳市光明区卫光生命科学园1A栋三层
硕士毕业于上海科技大学,主要负责超速离心机、蛋白纯化仪、细菌摇床、高压匀浆机等相关设备,擅长蛋白质的表达纯化与理化性质检测,掌握Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy(NMR)、Flow CytoMetry(FCM)、Cell Counting Kit-8(CCK-8)、ELISA等实验方法,参与过多项国自然科学基金项目。
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liubingru@smart.org.cn
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